高分子量蛋白（大于150 kD）Western Blot攻略
高分子量蛋白（大于150
kD）Western Blot攻略
注：該文引自基因幫公眾號天才試劑君文章，略有修改。 Ver.730875
● 一 選對凝膠很重要
三種最常見的凝膠系統(tǒng)包括Tris-Glycine, Bis-Tris and Tris-Acetate系統(tǒng)。
Tris-Glycine凝膠的pH為8.6，且保質(zhì)期很短，一般4-8℃保存有效期一個月。在跑膠的過程中，凝膠系統(tǒng)的pH還有上升的趨勢，可達到9.5，這會導致蛋白降解和低分辨率。
Bis-Tris凝膠的pH為~6.5，相對Tris-Glycine凝膠，穩(wěn)定性和保質(zhì)期都有所增加，4-8℃貯存可以保存一年。但這種凝膠更適合于低分子量電泳分離（低于200 kD），不適合高分子量蛋白電泳。
Tris-Acetate 凝膠的pH為~7，跑大分子蛋白會呈現(xiàn)很高的分辨率，同時4-8℃貯存可以保存一年。
所以跑大分子蛋白時，我們推薦使用Tris-Acetate 凝膠（貨號：RTD6162；RTD6155）。
● 二 凝膠濃度很重要
既然選擇了Tris-Acetate 凝膠，要考慮凝膠濃度的問題。凝膠濃度與孔徑成反比：濃度越小，孔越大，較大的蛋白質(zhì)更容易通過較大的孔，所以建議使用低百分比的Tris醋酸凝膠（貨號：RTD6162），如6％等度膠。也可以使用梯度凝膠，但是制作梯度凝膠會恨棘手，需要一個梯度凝膠生成系統(tǒng)（貨號：RT-GZY02），不過現(xiàn)在很多公司都會出售具有不同范圍的梯度預制膠（貨號：RTD6155），節(jié)省時間。
● 三 電泳內(nèi)槽緩沖液需要添加抗氧化劑
Tris-醋酸電泳使用10×Tris-醋酸-SDS電泳緩沖液（貨號：TA050），經(jīng)典的Tris-甘氨酸-SDS電泳緩沖液無法兼容使用。由于DTT在pH中性時，基本不隨著樣品泳動，為保證蛋白樣品在電泳中維持還原力，Tris-Acetate 凝膠電泳時，電泳槽內(nèi)槽緩沖液需要添加抗氧化劑（貨號：TA1510），這樣可以保證整個電泳過程中蛋白的變性還原狀態(tài)，提高樣品的分辨率。
● 四 提高轉(zhuǎn)膜緩沖液中的SDS，減少甲醇
高分子量蛋白轉(zhuǎn)膜緩沖液中的組成至關(guān)重要。如果有甲醇存在，大分子蛋白很容易沉淀，可以通過減少轉(zhuǎn)膜緩沖液中的甲醇百分比（10％或更低）來避免這種情況發(fā)生。為了進一步確保蛋白質(zhì)不會沉淀，考慮在轉(zhuǎn)膜緩沖液中添加SDS至終濃度為0.05%-0.1％。SDS向蛋白添加均勻的負電荷，使得它們更容易從凝膠轉(zhuǎn)移到膜上。高分子量蛋白的轉(zhuǎn)膜緩沖液可以選擇10×Tris-醋酸轉(zhuǎn)膜緩沖液（濕轉(zhuǎn)，粉末型）（貨號：TA5030P）
● 五 選擇合適的轉(zhuǎn)印膜
轉(zhuǎn)印膜一般有PVDF膜或NC膜，跑大分子蛋白建議選擇PVDF膜。如前面所說，如果有甲醇存在，大分子蛋白很容易沉淀。而PVDF膜可以不需要在轉(zhuǎn)膜緩沖液中添加甲醇，目的蛋白轉(zhuǎn)印的機會更高。PVDF膜有各種孔徑尺寸，最常見的是0.22 μm和0.45
μm。與凝膠一樣，較大的蛋白比較小的蛋白更容易穿過大孔隙。高分子量蛋白質(zhì)可以用0.45μm膜（貨號：ML-PV-131545-5）轉(zhuǎn)移，避免使用0.22 μm孔徑。
● 六 增加轉(zhuǎn)印時間
在正確的選擇完凝膠、轉(zhuǎn)印膜及轉(zhuǎn)移緩沖液后，轉(zhuǎn)印正式開始。半干轉(zhuǎn)快且方便，但不適用于大分子蛋白。大分子蛋白建議濕轉(zhuǎn)，因為大分子蛋白轉(zhuǎn)移時間很慢，推薦350-400 mA轉(zhuǎn)移90 min或 4℃，40 mA，轉(zhuǎn)印過夜。
● 七 關(guān)于轉(zhuǎn)印膜封閉
沒有任何一種封閉試劑能通用于蛋白封閉。BSA通常作為NC膜的封閉液，但是對于PVDF膜，它的封閉效果并不是最好。大蛋白轉(zhuǎn)膜后的封閉可以選擇5%脫脂奶粉（貨號：WN1070）。
另外，不要讓PVDF膜在檢測過程中的任何時間點干透，如果膜部分變干，可以讓膜完全干掉，然后用甲醇重新潤濕，之后用緩沖液浸泡，繼續(xù)操作。